Os primeiros a penetrar nas terras da Chapada Velha perceberam de distante um monte com forma de chapéu, logo começaram a chamar o Morro do Chapéu, este, sendo hoje o Morrão que tem uma atitude de 1.293m acima do nível do mar, e que é o ponto mais alto deste município. As primeiras explorações no território do município foram realizados pelos Jesuítas, os Bandeirantes também passaram por essa terra.

Lendárias são as notícias das passagens de Muribeca o descobridor das minas de prata e de Rogério Dias pelas terras de Morro do Chapéu. Diversas historias afirmam que, em 1551, quando os Jesuítas exploram as matas do Sincorá, por conseguinte as cabeceiras do Paraguaçu, foi explorado o rio que deram o nome de Riachão de Utinga e, dado ser zona fertilíssima, fixaram alguns exploradores fazendo plantações.

Entretanto o principal e definitivo fator do povoamento do município foi a concessão de grande área de terra ao 6º Conde da Ponte João Saldanha da Guerra de Mello e Torres, por Dom Fernando José de Portugal, com a finalidade de promover o povoamento, a partir daí foram fundadas as segundes fazendas: Morro ( Conhecido hoje por Morro Velho, lugar onde ouve a 1º missa ), Olho D’água, Canabravinha, Tapera, Santo Antônio, São Rafael, Jaboticaba, Morrinhos e Gurgulha. Um dos colonos Manoel Ferreira dos Santos,dquiriu terras 6º Conde da Ponte e, com seu filho Antônio, José e Domingos e José Joaquim Cardoso, fundaram a Fazenda Gameleira.

Contudo, o maior colonizador de então Antônio Guedes de Brito que possuía 160 léguas de terra, contadas de Morro de Chapéu até as águas do rio das velhas. Em 1724 conforme diz Luiz Santos Vilhena, quando se iniciou a exploração de ouro na freguesia de Jacobina, já se desenvolvia a criação de gado no território do atual município. Em 1795 chegou à Fazenda Morro o Missionário Capuchinho Frei Clemente Adorno, aí iniciou a catequese.

Por iniciativa de Frei Clemente Adorno, foi edificada uma capela na Fazenda Gameleira, pertencente a Antônio Ferreira dos Santos, o qual contribuiu muito para a edificação da capela de Nossa Senhora de Graça, doado um terreno como patrimônio, onde hoje situa-se a Igreja Matriz. Em 1823, a população aumentou devido os portugueses, refugiados da perseguição dos nacionais, resultante das lutas da independência do Brasil, os quais estabeleceram fazendas de gados.

A capela acaba de construir em 1834, foi elevado a freguesia por lei provincial n.º 67 de 1º de Julho de 1838, sob o orago de Nossa Senhora da Graça, desmembrada da freguesia de Santo Antônio de Jacobina, sendo seu primeiro vigário o Padre Francisco Gomes de Araújo. Naquela data, também, o povoado passou a chamar Morro do Chapéu à categoria de Vila e Município, formado pelas freguesia de Nossa Senhora da Graça e de Mundo Novo. Pela lei estadual n.º 751 de 08 de Agosto de 1909 a Vila Morro do Chapéu foi elevada a categoria de Cidade.